Речь идет о модуле Модуль Мои способы оплаты Opencart 3. Данный модуль настраивает способы оплаты для всех возможных правил. Так же учитывает методы доставки которые указаны в магазине. Причина по которой не видны методы доставки это использование сторонних методов генерации доставки в Opencart. В функции Opencart прописан метод который проверяет наличие физического файла модели и контроллера доставки и если такой не имеется, то метод не отображается в модуле Мои способы оплаты.